6. Модуль 6. Микробиологические исследования и диагностика инфекционных заболеваний

6

Модуль 6. Микробиологические исследования и диагностика инфекционных заболеваний

6.1

Методы исследований в микробиологической лаборатории

Методы лабораторной диагностики в микробиологической лаборатории. Биологический метод. Основы работы с биоматериалом в микробиологической лаборатории. Методология получения биоматериала, условия хранения, транспортировки. Микроскопические, биохимические и микробиологические (культуральные) методы в диагностике бактериальных, вирусных, грибковых и паразитарных болезней, особенности их методологии. Экспресс-методы идентификации микроорганизмов. Иммунологические методы в лабораторной диагностике инфекционных и паразитарных заболеваний: виды, принципы, методология проведения, чувствительность и специфичность, информативность. Молекулярно-биологические методы в диагностике бактериальных, вирусных, грибковых и паразитарных болезней. Физико-химические (масс-спектрометрия) методы в диагностике инфекций и инвазий: принцип метода, условия и методология проведения, информативность тестов. Биологический метод исследования и его место в диагностике инфекционных и паразитарных заболеваний. Биологические методы с использованием клеточных культур. Требования к клеточным линиям.

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-7, ПК-8

6.2

Алгоритмы и методы лабораторной диагностики бактериальных инфекций

Общие принципы и подходы к диагностике бактериальных инфекций. Лабораторная диагностика кишечных бактериальных инфекций. Лабораторная диагностика венерических бактериальных инфекций. Лабораторная диагностика бактериальных инфекций дыхательных путей и легких. Лабораторная диагностика бактериальных инфекций мочевых путей. Лабораторная диагностика трансмиссивных бактериальных инфекций. Лабораторная диагностика бактериальных инфекций центральной нервной системы. Лабораторная диагностика туберкулеза. Учет особенностей бактериальных инфекций и их локализации при назначении бактериологических исследований. Прямые и непрямые методы лабораторной диагностики, их информативность, специфичность, чувствительность. Причины получения ошибочных результатов. Комплексный подход к диагностике кишечных инфекций, вызванных патогенными бактериями. Диагностика шигеллеза, сальмонеллеза кампилобактериоза, эшерихиоза, иерсиниоза, брюшного тифа, холеры. Лабораторная диагностика сифилиса, гонококковой инфекции, хламидиоза, микоплазмоза. Санитарно-эпидемиологические правила сбора биологических материалов. Микроскопическое исследование. Бактериологические методы диагностики. Методы выделения культур микобактерий, идентификации и определения чувствительности микобактерий к препаратам противотуберкулезной химиотерапии. Ускоренные методы диагностики туберкулеза (молекулярно-генетические исследования, люминесцентная микроскопия).

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-7, ПК-8

6.3

Особенности и алгоритмы лабораторной диагностики вирусных инфекций

Основные подходы к лабораторной диагностике вирусных инфекций. Алгоритмы лабораторной диагностики инфекционных заболеваний: методы выявления возбудителей, серологические исследования, молекулярно-генетические методы. Особенности лабораторной диагностики инфекционных заболеваний в различных клинических ситуациях: учет специфики возбудителей, стадий заболевания и состояния пациента. Вирус иммунодефицита человека: алгоритмы и методы клинико-лабораторной диагностики, особенности интерпретации результатов лабораторных исследований. Лабораторная диагностика вирусных гепатитов: алгоритмы и методы исследования Лабораторная диагностика коронавирусной инфекции. Особенности лабораторной диагностики природно-очаговых вирусных инфекций человека. Общие принципы, подходы и методы диагностики вирусных инфекций. Источники получения ошибочных результатов. Алгоритмы, информативные методы лабораторной диагностики, основные лабораторные показатели, динамика их появления и особенности интерпретации результатов лабораторных тестов при вирусных инфекциях. Лабораторная диагностика инфекций, вызванных вирусом простого герпеса, цитомегаловирусом, вирусом Эпштейн-Барр, вирусом папилломы человека: подходы и методы диагностики, биоматериал для исследования, лабораторные показатели и их интерпретация.

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-7, ПК-8

6.4

Биохимические и молекулярные особенности функционирования микробиоты человека

Понятие микробиома человека и его состав. Роль микробиома в регуляции иммунной системы. Участие микробиома в метаболизме и пищеварении. Симбиотические взаимоотношения микробиома и организма человека. Микробиом кожи: состав и особенности. Микробиом полости рта: виды микроорганизмов и их влияние. Микробиом верхних дыхательных путей: состав и значение. Формирование микробиома кишечника и его особенности. Микробиом репродуктивной системы и его особенности. Роль микробиома в защите от патогенных микроорганизмов.

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-5, ПК-6, ПК-7, ПК-8

6.5

Алгоритмы лабораторной диагностики социально-значимых инфекционных заболеваний человека

Социально-значимые инфекционные заболевания: основные принципы, методы и их значение для общественного здравоохранения. Алгоритмы лабораторной диагностики социально-значимых инфекционных заболеваний: методы выявления возбудителей, серологические исследования, молекулярно-генетические методы. Особенности лабораторной диагностики социально-значимых инфекционных заболеваний в различных клинических ситуациях: учет специфики возбудителей, стадий заболевания и состояния пациента.

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-5, ПК-6, ПК-7, ПК-8

6.6

Промежуточная аттестация по модулю 6

Контроль результатов обучения в рамках освоения тем 6.1 - 6.5.

ПК-1, ПК-2, ПК-3, ПК-4, ПК-5, ПК-6, ПК-7, ПК-8