Требования к буквенным обозначениям нуклеотидов в файлах

- в случае наличия не покрытых (неотсеквенированных) областей в геноме, они должны быть замаскированы последовательностью, состоящей из букв NNN;

- в случае наличия вырожденных нуклеотидных позиций они обозначаются вырожденным кодом, согласно номенклатуре IUPAC (например R, для обозначения A/G и т.п.)".