VI. Биологические науки

50. Биология развития и эволюция живых систем

разработка теорий индивидуального и исторического развития живых систем всех уровней организации;

создание моделей становления и эволюции биосферы, включая начальные этапы ее развития;

разработка проблем происхождения жизни и астробиологии;

исследование эволюционных преобразований структуры и функций субклеточных структур;

проведение реконструкции и модификации геномов методами хромосомной и генной инженерии;

исследование эволюции эукариот на уровне геномов, структурно-функциональных единиц генома, генов, хромосом и хромосомных наборов;

определение скоростей морфологических преобразований и особенностей морфогенеза и эволюции эукариот;

раскрытие адаптационных механизмов, регулирующих строение систем органов и их восстановительный потенциал;

выяснение генетических, молекулярных и клеточных механизмов морфогенеза биоминеральных структур;

изучение эволюционных и адаптационных преобразований на основе анализа полиморфизма, параллелизмов и гетерохроний;

сопоставление и согласование полученных на ископаемом и современном материале данных по эволюционной морфологии с результатами молекулярно-генетических исследований;

разработка теоретических и методологических основ эпигенетической концепции эволюции на основе представлений о целостности организмов в онто- и филогенезе;

выяснение механизмов контроля молекулярно-генетических систем и процессов;

разработка проблем становления морфофункциональной организации высоких таксонов на основе выяснения генезиса, темпов и механизмов структурных перестроек на разных уровнях;

выявление принципиально новых типов организации ископаемых организмов, имеющих большую эволюционную значимость;

разработка проблем микроэволюции, включая симпатрическое формообразование в центрах диверсификации;

разработка проблемы эволюционного формирования морфологического и генетического мономорфизма вида;

исследование роли симбиогенеза в процессах эволюции живого мира;

создание экспериментальных моделей эволюционных преобразований;

изучение физиолого-биохимических изменений в процессе доместикации животных и их использование в качестве модели эволюционных процессов;

создание общей теории эволюции онтогенезов;

разработка концепции эволюции регуляторных механизмов индивидуального развития (генных сетей) и эпигенетических регуляций, обосновывающей взаимодействие различных уровней организации живых систем;

определение роли гетерохроний в эволюционных преобразованиях онтогенеза;

выявление генетических и эпигенетических механизмов регуляции индивидуального развития, молекулярных основ дифференцировки и трансдифференцировки клеток и тканей, механизмов регенерации и трансплантации тканей и органов;

разработка методов устранения дефицита нейро- и иммуномедиаторов, предотвращающих необратимые изменения в развитии органов иммунной системы;

выявление особенностей формирования систем стволовых клеток в онтогенезе, механизмов восстановительных процессов в норме и при различных патологических состояниях;

изучение клеточных и молекулярных механизмов, регулирующих онтогенез и отдельные его стадии, в эволюционном и экологическом аспектах;

разработка технологии управления дифференцировкой и пролиферацией клеток;

развитие методов репродуктивной биологии;

исследование клонирования животных на основе методов партеногенеза, андрогенеза и гиногенеза, развития и восстановления половых клеток, причин нарушений плодовитости под влиянием факторов окружающей среды;

использование трансгенеза и химического мутагенеза для анализа проблем биологии развития;

создание моделей патологических состояний человека и животных: исследование генетико-физиологических, биохимических, молекулярно-генетических и биофизических механизмов и поиск путей коррекции;

выяснение генетико-физиологических механизмов гормональной регуляции висцеральных функций и поведения;

познание основных закономерностей и механизмов онтогенеза животных различных экологических и филогенетических групп с детальным изучением молекулярных, биохимических, клеточных и тканевых особенностей их индивидуального развития;

разработка моделей морфогенеза растений и создание экспериментальных систем их верификации

51. Экология организмов и сообществ

выявление факторов, механизмов и закономерностей функционирования и динамики живых систем (популяций, видов, сообществ, экосистем), разработка теории формирования их адаптивных стратегий на основе комплексных исследований экологии, поведения, физиологии и морфологии, экологической биохимии и генетики;

разработки моделей эволюционных и катастрофических изменений отдельных сообществ и биосферы в целом для прогнозирования этих процессов в будущем;

разработки моделей коэволюции различных групп органического мира, их биотических взаимоотношений и сопряженного воздействия на биосферу;

исследование принципов формирования симбиотических и паразитарных ассоциаций;

разработка научных основ технологий прогнозирования последствий (включая эволюционные) глобальных изменений климата и антропогенных воздействий на структуру и функционирование организмов и экосистем;

разработка методологии организации мониторинга экосистем, оценка их ресурсного потенциала и биосферных функций;

выявление поведенческих и эколого-физиологических механизмов популяционного гомеостаза животных;

классификация и инвентаризация разнообразия типов растительных сообществ России и ближнего зарубежья;

создание теоретических основ адаптаций и сохранения разнообразия растений, анализ функционирования и оценка устойчивости фитосистем в условиях изменения окружающей среды и воздействия человека;

создание структурно-функциональных моделей лесов разного целевого назначения (эксплуатационного, защитного, рекреационного) с программируемым развитием в целях решения социально-экономических задач и обеспечения экологической безопасности;

разработка национальной системы дистанционного мониторинга состояния и динамики лесных экосистем;

разработка методов, алгоритмов и моделей долгосрочного прогнозирования динамики породно-возрастной структуры лесов, их ресурсно-экологического потенциала, оценки и прогноза состояния и динамики лесных экосистем, их биологического разнообразия в условиях глобального изменения климата при различных сценариях лесопользования в условиях глобальных изменений климата;

изучение основных физиолого-биохимических и молекулярно-генетических механизмов устойчивости растений к стрессовым воздействиям биогенной и абиогенной природы;

выявление факторов и закономерностей динамики популяций и сообществ пресноводных экосистем, разработка теории формирования адаптивных стратегий и гомеостаза живых систем;

изучение экологии донных организмов, разнообразия, динамики и функциональных особенностей зообентоса в морских, прибрежных и пресноводных экосистемах;

изучение экологии, разнообразия и эволюционных особенностей планктонных организмов в условиях изменяющегося климата;

определение индикаторов и параметров для мониторинга и контроля состояния морских экосистем в районах добычи углеводородов и интенсивного изъятия биоресурсов;

раскрытие механизмов развития приспособительных реакций гидробионтов на клеточном, субклеточном, биохимическом и молекулярно-генетическом уровне, выявление эволюционных, экологических, возрастных особенностей этого процесса;

разработка концепции и методологии мониторинга наземных и водных экосистем, находящихся в зоне промышленных предприятий, научных основ реабилитации нарушенных экосистем, методологии динамического картографирования экосистем;

разработка биотехнологических способов защиты технических сооружений и продукции производства от повреждающих организмов

52. Биологическое разнообразие

оценка состояния и динамики современного биоразнообразия, выявление его ресурсных и средообразующих функций, исследование истории формирования;

разработка методов управления биопродукционными процессами, технологий сохранения и рационального использования биоресурсов;

разработка научных основ мониторинга биоразнообразия и состояния окружающей среды, основных показателей их ресурсного потенциала и биосферных функций;

создание региональных баз данных по биоразнообразию, WEB-ориентированных информационных систем, включающих интегрированную базу данных по биоразнообразию;

разработка научных основ технологий сохранения и восстановления редких, исчезающих и хозяйственно-ценных видов живых организмов;

развитие дистанционных и неинвазивных методов исследований животных, в том числе спутниковой телеметрии, иммуноферментных и молекулярно-генетических методов диагностики;

получение новых данных о морфофункциональной организации, систематике, распространении и значении в динамике биосферы наиболее важных групп организмов;

разработка комплексных методов сохранения (инвентаризация, мониторинг, использование) и воспроизводства биологического разнообразия и генетических ресурсов животных и растений России;

контроль за изменением границ ареалов гидробионтов и оценка влияния видов-вселенцев на биоразнообразие и продуктивность пелагических и донных биоценозов морей России;

разработка рекомендаций по охране конкретных видов животных, находящихся под угрозой исчезновения, подготовка новых редакций Федерального закона "О животном мире", Экологической доктрины Российской Федерации, Национальной стратегии сохранения биоразнообразия России, проектов стратегии сохранения редких видов России, концепции биосферных заповедников, новых редакций Красной книги Российской Федерации (животные), Красной книги города Москвы и Красной книги Московской области, красных книг других субъектов Российской Федерации, подготовка ряда серийных многотомных изданий и монографических справочников, определителей, атласов и каталогов;

создание новых сортов и отбор уже существующих видов и сортов декоративных многолетних растений, устойчивых в средней полосе России, размножающихся и пригодных для выращивания в зеленых насаждениях различного назначения;

существенное пополнение ассортимента плодовых, ягодных, лекарственных и эфиромасличных растений, пригодных для введения в культуру в средней полосе России, разработка технологий их выращивания;

изучение генофондов и генетического разнообразия природных и экспериментальных популяций;

разработка методов охраны и неистощительной эксплуатации генофондов ресурсных видов животных и растений на основе мониторинга и поддержания генетической структуры с помощью нейтральных и адаптивно-важных молекулярных маркеров;

выяснение механизмов формирования генетического разнообразия растений;

создание коллекций уникальных генофондов растений;

изучение механизмов интрогрессивной гибридизации и генетического контроля стрессоустойчивости растений;

сравнительные исследования геномов, генетического разнообразия и филогении культурных растений и их сородичей методами молекулярно-генетического и хромосомного анализа;

разработка научных основ утилизации генетических ресурсов дикорастущих видов;

разработка методов генетического мониторинга популяций редких и исчезающих видов растений, обоснование подходов и мероприятий по сохранению их генофондов

53. Общая генетика

выяснение молекулярно-генетических и популяционных механизмов генотипической и фенотипической изменчивости;

разработка концептуальных основ управления генофондами экономически и экологически значимых организмов;

молекулярно-генетическое картирование геномов сельскохозяйственных растений и животных, биотехнологически ценных микроорганизмов;

разработка систем идентификации чистоты и паспортизации пород домашних животных и сортов растений Российской Федерации, систем генетического тестирования сельскохозяйственных животных;

исследование генофондов и популяционно-генетической структуры важнейших видов гидробионтов, разработка методов прогнозирования ресурсов хозяйственно-ценных видов;

разработка эффективных методов селекции и генетической инженерии на базе геномных и постгеномных технологий;

разработка методов создания и применения генетически модифицированных организмов;

изучение генетических систем симбиогенеза;

описание структурно-функциональной геномики и взаимодействия паразитов и их хозяев на геномном, транскриптомном и протеомном уровнях;

физическое картирование и секвенирование генома хозяйственно-ценных видов, выявление генов, контролирующих развитие ценных признаков растений и животных, разработка молекулярных маркеров для селекции;

изучение структуры генофонда и истории формирования народов России и развитие фундаментальных основ ДНК-идентификации человека с использованием геномных технологий;

составление подробных описаний, баз данных и карт, характеризующих генофонды народов России и соседних стран;

разработка научных основ высокопроизводительных методов и алгоритмов идентификации и картирования генов на основе результатов полногеномного генотипирования и ресеквенирования;

создание фундаментальных основ для фармакогенетических исследований на основе полученных данных об этно-территориальном распределении частот генов, влияющих на развитие широко распространенных и социально значимых заболеваний;

идентификация генетических вариаций, ассоциированных с повышенной чувствительностью к физическому и химическому загрязнению окружающей среды;

разработка принципиально новых систем тестирования первичных предмутационных повреждений ДНК;

разработка тест-систем для оценки мутагенной и канцерогенной активности ксенобиотиков, лекарственных средств и различных материалов;

характеристика роли мобильных элементов в генетической изменчивости хозяина, оценка их влияния на приспособляемость и продолжительность жизни;

установление закономерностей коэволюции мобильных элементов эукариот и геномов их хозяев;

применение методов метагеномики для решения задач экологии, биотехнологии и медицины, включая изучение микробиома человека и создание банка пробиотических бактерий, выделенных из микробиот различных организмов;

определение специфики видового и штаммового состава пробиотических бактерий жителей России в зависимости от района обитания, возраста, состояния здоровья;

разработка новых методов контроля состояния микробиоценозов человека, включая метагеномные;

создание генетически модифицированных организмов, пригодных для использования в качестве продуцентов фармакологически ценных белков;

исследование механизмов генетического репрограммирования клеток человека для разработки методов диагностики, лечения и профилактики социально значимых заболеваний;

разработка методов генотерапии;

создание новой концепции биобезопасности, учитывающей новые типы антропогенных воздействий;

изучение генетических факторов и молекулярных механизмов патогенеза иммуноопосредованных воспалительных и неврологических заболеваний, стресса и алкоголизма;

выявление новых генетических и эпигенетических маркеров, предназначенных для ранней дифференциальной диагностики в онкологии, нейрологии, гастроэнтерологии, урологии для разработки высокотехнологичных подходов к лечению различных заболеваний, в том числе наследственных патологий;

валидизация методов генетической паспортизации населения с учетом молекулярно-генетических и эпигенетических характеристик этнической принадлежности и сферы профессиональной деятельности

54. Почвы как компонент биосферы (формирование, эволюция, экологические функции)

изучение закономерностей формирования и функционирования почвенного покрова в геологической истории Земли;

исследование кризисных и оптимальных этапов в истории почвообразования как ретроспективной основы для оценки современного состояния почвенного покрова и прогноза его развития в результате глобальных и региональных изменений климата;

разработка методических и теоретических основ изучения палеопочв как индикаторов состояния и эволюции биосферы в различные геологические и исторические эпохи;

интеграция палеопочвоведения, данных палеонтологии и археологии в познании истории природной среды и древних обществ;

оценка влияния глобальных климатических изменений и хозяйственной деятельности человека на состояние почв, направленность элементарных почвенных процессов и регулирование циклов биофильных элементов в наземных экосистемах;

развитие концепции экологического контроля почв и нормирования антропогенных воздействий на наземные экосистемы по биотическим показателям;

разработка методических основ и системы экологической оценки состояния почв на основе данных биоиндикации, биотестирования и химико-аналитических данных;

изучение роли криогенеза в формировании и эволюции почв, в глобальном круговороте веществ и энергии в биосфере и консервации генетических ресурсов;

биогеографические закономерности эволюции почв в связи с вековой изменчивостью факторов почвообразования;

пространственно-временные закономерности развития и роль биологических, биогеохимических и физико-химических процессов в природном и антропогенном трендах почвообразования;

оценка экологической роли почв и почвенного покрова в эмиссии и стоке парниковых газов;

изучение экологической роли почв в формировании и сохранении планетарного биологического разнообразия;

установление закономерностей развития и механизмов адаптации микробных сообществ почв на физиологическом, эколого-трофическом, морфологическом и генетическом уровнях в экстремальных и изменяющихся условиях природной среды;

изучение закономерностей и динамических трендов формирования животного населения почв, адаптаций животных к среде обитания и роли зоогенных факторов в почвообразовании;

изучение структуры микробных сообществ основных типов почв в целях выявления ключевых групп генов и геномов, определяющих базовые процессы почвообразования и развития растений;

разработка структуры и программного обеспечения системы моделей для математического моделирования циклов биофильных элементов и сукцессионных процессов в системе "почва - растительность - атмосфера";

методики мониторинга техногенного загрязнения почв и рекультивации антропогенно нарушенных территорий

55. Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов

выделение "некультивируемых" в лабораторных условиях микроорганизмов, детектируемых молекулярно-биологическими методами, и определение их функциональной роли в биосфере;

разработка методов анализа метагеномов микробных сообществ;

расширение знаний о "микробиоме человека";

метагеномный и транскриптомный анализ микробных сообществ биосферы и подземных экосистем в условиях изменяющегося климата и экстремальных явлений;

идентификация полиэкстремофильных микроорганизмов, изучение механизмов их устойчивости;

характеристика микробных сообществ, обитающих в различных экологических нишах;

выделение новых термофильных и анаэробных архей и бактерий на основе анализа их полных геномных последовательностей;

описание новых морских микроорганизмов на основе изучения их фено-, гено- и филотипов;

молекулярная идентификация ультрамикроформ и неизученных филогенетических групп бактерий ультрапресных вод;

выявление микробного потенциала древних природных экосистем: исследование покоящихся микробных сообществ озер Антарктиды и вечномерзлых почв тундровой зоны Арктики;

создание молекулярных маркеров для оценки экспрессии ключевых функциональных генов;

изучение структуры и функций ключевых ферментов центрального и периферического метаболизма микроорганизмов;

изучение генетико-физиологических и экологических аспектов разнообразных проявлений социального поведения ("коллективизма") бактерий;

исследование новых ризосферных, филлосферных и эндофитных штаммов бактерий-антагонистов фитопатогенов;

установление полного спектра инфекционных агентов, переносимых клещами, и их характеристика методом полногеномного секвенирования;

идентификация и изучение новых бактериофагов;

установление закономерностей генетического дрейфа циркулирующих вирусов, вызывающих социально значимые инфекционные заболевания;

разработка экологически чистых и высокоэффективных биотехнологий повышения нефтеотдачи;

совершенствование технологий извлечения цветных и благородных металлов;

выявление возбудителей биокоррозии и разработка эффективных мер борьбы с разрушением металлических конструкций;

исследование структуры и динамики микробных консорциумов, поиск новых перспективных микроорганизмов для целей биотехнологии, исследование их генетики и метаболизма;

исследование физиологии, биохимии и биотехнологического потенциала мицелиальных грибов;

создание научных основ биотехнологии очистки природных и антропогенных экосистем от углеводородных, токсичных и устойчивых загрязнений в различных климатических зонах;

исследования механизмов взаимодействия растений и ризосферных бактерий, содержащих плазмиды биодеградации и устойчивости к токсичным соединениям;

разработка новых биоремедиационных технологий на основе растительно-микробных ассоциаций;

изучение деструктивного потенциала высших грибов в отношении персистентных антропогенных загрязнений

56. Физиология и биохимия растений, фотосинтез, взаимодействие растений с другими организмами

изучение структур фотосинтетического аппарата, выяснение молекулярных основ первичного преобразования энергии света при фотосинтезе, фотосинтетического транспорта электронов и окисления воды, фотофосфорилирования, метаболизма углерода, кислорода и водорода, стресс-устойчивости фотосинтеза;

изучение возможности повышения эффективности функционирования и регуляции фотосинтетических систем и создания искусственного фотосинтеза;

оценка вклада фотосинтетического стока углекислоты в баланс углерода над территорией России в рамках международной конвенции по глобальному климату;

исследование механизмов реализации экспрессии генов на уровне сложных физиологических функций;

исследование физиологических и молекулярных механизмов действия сигнальных факторов регуляции роста и онтогенеза;

выяснение механизмов генерации активных форм кислорода и их участия в процессах метаболизма и межклеточной сигнализации;

поиск генов внутриклеточного и межорганного сигналинга, идентификация биологических функций кодируемых ими белков;

изучение механизмов действия природных и синтетических регуляторов физиологических процессов;

исследование характера взаимодействия фитогормонов, а также веществ гормональной и углеводной природы при регуляции роста, цветения и клубнеобразования;

создание методологии управляемого онтогенеза и продуктивности растений;

исследование эволюции сигнальных систем у растений, идентификация новых регуляторных белков;

изучение регуляции экспрессии хлоропластного и митохондриального геномов;

поиск сигналов внутриклеточных межгеномных коммуникаций;

исследование стратегии и механизмов адаптации и выживания растений в условиях нестабильного климата и техногенного давления на окружающую среду;

установление систем общей и специализированной устойчивости, а также контролирующих их генов в целях получения стресс-толерантных форм;

идентификация сенсоров восприятия стресс-факторов различной физической природы и компонентов цепи трансдукции стрессорного сигнала;

изучение механизмов энергообеспечения модельных и хозяйственно значимых видов растений в неблагоприятных условиях и разработка принципов функционирования регуляторных молекул различной природы в стрессорных условиях;

выяснение механизмов трансмембранного переноса молекул воды, ионов и эссенциальных элементов;

исследование систем внутриклеточного гомеостатирования тяжелых металлов;

исследование механизмов формирования клеточной стенки как основного компонента возобновляемого сырья;

изучение ферментов синтеза, модификации и деградации сложных углеводов и гликоконъюгатов;

исследование механизмов регуляции метаболизма и катаболизма жирных кислот и ацетилированных диацилглицеринов у высших растений, выяснение биологической роли необычных жирных кислот в процессе онтогенеза и адаптации;

изучение культур клеток высших растений как уникальной биологической системы - искусственной популяции постоянно пролиферирующих клеток;

конструирование новых форм растений с заданными свойствами с использованием молекулярных биотехнологий;

изучение физиологии трансгенного растения;

получение новых данных о механизмах взаимодействий партнеров в растительно-микробных ассоциациях;

разработка фундаментальных основ фиторемедиации;

выяснение молекулярных механизмов локального и системного фитоиммунитета;

создание и поддержание профильных коллекций растений

57. Структура и функции биомолекул и надмолекулярных комплексов, протеомика, биокатализ

идентификация и характеристика выделенных из биологических объектов новых эндогенных биорегуляторов;

получение биологически значимых рекомбинантных белков методом молекулярного клонирования;

расшифровка пространственных структур значительного числа белков и макромолекулярных комплексов;

исследование роли протяженных неструктурированных участков полипептидной цепи в структуре и функциях белков;

анализ механизмов взаимодействия полибелковых комплексов и комплексов белков с различными низко- и высокомолекулярными веществами и наночастицами абиогенной природы;

выявление внутриклеточных механизмов защиты и регуляции белков при окислительном стрессе;

изучение стереохимических основ специфических взаимодействий в структурах фибриллярных биополимеров (НК, белки) и их комплексов;

изучение механизмов регуляции протеасомной системы деградации белков в клетке;

системный анализ белкового состава клеток и тканей методами протеомики и пептидомики как основы развития молекулярной диагностики различных заболеваний человека и животных;

разработка высокочувствительных аналитических систем для выявления специфических последовательностей нуклеиновых кислот;

разработка проблем нанотехнологии нуклеиновых кислот;

анализ образцов древней ДНК основных видов плейстоценовой и голоценовой фауны Сибири;

выяснение механизмов действия ключевых ферментов клеточного метаболизма;

исследование надмолекулярных комплексов, базирующихся на полимерных углеводах и гликоконъюгатах;

характеристика принципов взаимодействия углеводных полимеров;

выяснение взаимосвязи структуры и биологической активности полисахаридов;

изучение ферментов синтеза, модификации и деградации сложных углеводов и гликоконъюгатов;

разработка методов применения биокатализа в энергетике и органическом синтезе;

выяснение механизмов взаимодействия биологически активных соединений с внутриклеточными и инфекционными мишенями;

молекулярный дизайн и синтез новых модуляторов клеточной активности с заранее заданными свойствами, в том числе ингибиторов ферментов как потенциальных терапевтических препаратов;

разработка новых подходов молекулярной диагностики, профилактики и лечения конформационных патологий человека, включая болезнь Альцгеймера, на основе использования патогенных изоформ белков и их фрагментов в качестве биомаркеров и лекарственных мишеней;

установление механизмов расщепления вирус-специфических белков каталитическими антителами;

химический синтез природных фармакологически активных соединений и их аналогов, являющихся основой для создания лекарственных препаратов нового поколения;

разработка подходов к синтезу соединений неизвестных структурных классов

58. Молекулярная генетика, механизмы реализации генетической информации, биоинженерия

анализ структур геномов, транскриптомов, протеомов, пептидомов;

исследование взаимодействий их компонентов;

выявление сетей молекулярных взаимодействий (интерактомов) и новых свойств, возникающих в процессе их образования внутри клетки;

исследования регуляторных элементов генома (энхансеров, инсуляторов, сайленсеров), их взаимодействий с факторами транскрипции, другими регуляторными белками и РНК;

определение механизмов сборки в ядре многокомпонентных белковых комплексов и выяснение их роли в регуляции экспрессии генов;

идентификация новых компонентов инсуляторных комплексов у дрозофилы и млекопитающих;

выяснение роли ДНК-связывающих транскрипционных факторов в осуществлении связи транскрипции и репликации;

установление механизмов позиционирования ориджинов репликации на хромосомах высших эукариот;

идентификация транскрипционных факторов, обеспечивающих сайт-специфичное связывание с хромосомами комплексов дозовой компенсации и ремоделирования хроматина;

исследование посттранскрипционных механизмов регуляции экспрессии генома;

установление взаимосвязи между транскрипцией, сплайсингом, транспортом мРНК и трансляцией у высших эукариот;

выяснение механизмов транс-сплайсинга и регуляции альтернативного сплайсинга;

идентификация роли различных посттрансляционных модификаций транскрипционных факторов в транспорте из цитоплазмы в ядро и формировании функциональных комплексов;

определение структуры и функции компонентов системы биосинтеза белка, вовлеченных в инициацию и регуляцию трансляции;

исследование новых механизмов инициации и регуляции трансляции у эукариот;

идентификация сайтов рибосомных белков, осуществляющих взаимодействие с мРНК и пептидов, вовлеченных в процесс сплайсинга пре-мРНК рибосомных белков;

исследования пространственной организации функциональных процессов в клетке;

определение состава и локализации белковых комплексов, определяющих инициацию транскрипции, репликации и ремоделинга нуклеосом в интерфазных хромосомах, а также определение межмолекулярных взаимодействий этих процессов;

характеристика молекулярных механизмов, контролирующих экспрессию индивидуальных генов и групп генов на уровне пространственной организации генома эукариотической клетки;

выяснение механизмов дистанционных взаимодействий между регуляторными элементами в геноме;

раскрытие роли основных регуляторных элементов (энхансеров, промоторов, инсуляторов и участков прикрепления к ядерному матриксу) в формировании и поддержании функционально-зависимой архитектуры эукариотического генома;

выяснение роли пространственной организации эукариотического генома в определении предпочтительных позиций хромосомных перестроек, в том числе перестроек, ассоциированных с различными заболеваниями человека;

изучение эпигенетических механизмов регуляции генома животных, модификаций хроматина, метилирования ДНК;

исследование структуры и функций РНК, не кодирующих белки, в том числе микроРНК, и их роли в регуляции экспрессии;

установление механизмов функционирования малых интерферирующих РНК;

изучение механизмов воздействия внешней среды на эпигенетический аппарат эукариотических клеток;

исследования роли эпигенетических процессов в развитии организма и возникновении патологий, включая онкологические заболевания;

установление роли наиболее охарактеризованных модификаций хроматина в регуляции транскрипции и созревании мРНК;

исследование механизмов нестабильности геномов: увеличения копийности генов, транспозиций, ретротранспозиций, хромосомных аберраций и их связи с процессами эволюции и возникновения патологий;

выяснение причин и механизмов геномной нестабильности, связанных с апомиктическим и амфимиктическим размножением животных и растений;

установление корреляций между аллельным полиморфизмом генов нейромедиаторных систем и разными формами поведения;

изучение генетической структуры и филогенетических взаимоотношений народов Евразии с использованием полногеномного анализа SNP и полногеномного секвенирования;

исследования корреляции изменений экспрессии генов с полиморфизмами геномов;

выяснение роли полиморфизмов геномов в развитии, а также в восприимчивости и устойчивости к заболеваниям и процессах нормального старения;

идентификация генов, ассоциированных с долголетием человека;

исследование ассоциаций между генетическим полиморфизмом и продолжительностью жизни на модельных объектах;

интеграция и анализ методами биоинформатики массивов данных, генерируемых новыми поколениями методов секвенирования;

развитие технологий внутриклеточного и внутриорганизменного имаджинга живых систем и их использование для исследований внутриклеточных и внутриорганизменных процессов в норме и при патологических изменениях;

разработка методов использования однодоменных антител, слитых с флуоресцентным белком, для исследования внутриклеточных процессов в условиях, наиболее приближенных к естественным;

расшифровка функций генов в моногенных и сложных заболеваниях, включая рак, атеросклероз, диабет и заболевания иммунной и нервной систем;

исследование молекулярно-генетических основ наследственных и наследственно обусловленных социально значимых заболеваний человека;

разработка молекулярных платформ для ранней диагностики различных заболеваний;

создание технологий генной терапии наследственных заболеваний на основе высокоспецифичных ДНК-связывающих доменов;

развитие генно-терапевтических систем терапии онкологических заболеваний;

создание на основе малых РНК средств терапии опухолевых и вирусных заболеваний;

идентификация кластеров генов, кодирующих новые антибиотики;

аннотирование новых бактериофагов, инфицирующих различные бактерии, включая патогенные;

выявление новых механизмов инфицирования бактериальных клеток бактериофагами;

раскрытие механизмов регуляции экспрессии фаговых и клеточных генов в процессе инфекции;

исследования взаимодействий "патоген - хозяин" при бактериальных и вирусных инфекциях;

использование генных технологий для улучшения сортов растений и пород животных методами трансгеноза;

разработка технологий получения растительных и животных "биофабрик" - продуцентов рекомбинантных белков человека и моноклональных антител

59. Молекулярные механизмы клеточной дифференцировки, иммунитета и онкогенеза

определение роли линкерных гистонов в эмбриональных стволовых клетках, установление общего уровня их экспрессии и посттранскрипционных модификаций;

расшифровка молекулярных механизмов контроля экспрессии регуляторов транскрипции, необходимых для поддержания и индукции плюрипотентного состояния клеток;

выявление молекулярных механизмов дифференцировки стволовых клеток человека и животных под действием факторов физической и химической природы;

анализ особенностей дифференцировки клеток в растительном организме;

выявление роли сестринов в регуляции метаболизма;

расшифровка механизмов антиоксидантной активности пероксиредоксинов;

определение модуляторов активности амф-зависимой протеинкиназы и TOR-киназы;

анализ роли аутофагии в предотвращении клеточного старения;

характеристика молекулярных механизмов секреции белков теплового шока;

роль экстраклеточных стрессовых белков в формировании резистентности клеток к действию повреждающих факторов, в коррекции клеточных патологий и в индукции противоопухолевого и противобактериального иммунитета;

расшифровка молекулярных механизмов избирательного действия цитотоксических экзогенных белков на злокачественные клетки, выявление специфических внутриклеточных мишеней этих белков и разработка подходов направленной элиминации опухолевых клеток;

разработка модельной системы для скрининга веществ, способных воздействовать на ключевые белки, регулирующие клеточную поляризацию;

определение молекулярных механизмов реактивации программы клеточного старения как подход к терапии опухолей;

разработка метода повышения чувствительности опухолевых клеток к действию ДНК-повреждающих агентов;

выявление генетических программ старения, смерти и механизмов нарушения нормального развития животных и растительных клеток;

определение противоопухолевой активности панели антител, взаимодействующих с онкоассоциированными ганглиозидами;

исследование новых молекулярных мишеней для диагностики и терапии онкологических заболеваний;

определение роли различных сигнальных путей (в том числе с участием онкогенов) в формировании злокачественного фенотипа опухолевых клеток и опухолевой прогрессии;

изучение механизмов опухолевой супрессии под действием p53;

выявление механизмов регуляции цитоскелета в норме и при патологии, включая раковые и нейродегенеративные заболевания;

роль опухолевого супрессора PDLIM4 в динамике цитоскелета и активации протоонкогенов;

выяснение роли эмбриональных индукторов, участвующих в геномной регуляции развития мозга, и малых ГТФаз, регулирующих обмен сигналами в эмбриогенезе;

анализ иммуномодулирующих эффектов конструкций, содержащих комбинации миелопептидов, в целях разработки подходов к применению новых иммунокоррегирующих препаратов;

выявление механизмов модуляции активности клеток иммунной системы и изменений их транскрипционных программ в норме и при патологиях;

характеристика молекулярных механизмов, регулирующих ответ опухолевых клеток на иммуномодуляторы;

выявление динамики запрограммированной смерти опухолевых клеток под действием цитотоксических веществ, секретируемых лимфоцитами;

выработка стратегии идентификации и селективной супрессии патологических клонов T-лимфоцитов при аутоиммунных и онкологических заболеваниях;

анализ аутоантигенного репертуара опухолей человека и идентификация новых объектов и мишеней для иммунотерапии и иммунодиагностики злокачественных новообразований;

анализ молекулярных механизмов T- и B-клеточного иммунного ответа с участием белков врожденного иммунитета, определение хемотоксической и цитотоксической функции этих белков, их роли в активации цитотоксических лимфоцитов и изменении цитокиновой активности;

выяснение роли рецепторов нейромедиаторов в регуляции функций Т-лимфоцитов в норме и при аутоиммунных заболеваниях человека;

экспрессия и очистка рекомбинантных белков, соответствующих лиганд-связывающим доменам рецепторов, распознающих двуспиральные нуклеиновые кислоты в рамках исследования молекулярных механизмов врожденного иммунитета;

выявление динамики запрограммированной смерти тромбоцитов при изменениях, вносимых стимуляцией сигнализации через интегриновые белки;

разработка методов повышения эффективности иммунной системы организма;

анализ компонентов внутриклеточного противовирусного иммунитета

60. Клеточная биология, теоретические основы клеточных технологий

получение новых линий стволовых и индуцированных плюрипотентных клеток;

выявление кариотипической изменчивости, генетической стабильности и экспрессии системы репарации ДНК в процессе культивирования стволовых клеток;

типирование стволовых клеток по поверхностным антигенам, анализ взаимодействия различных рецепторных систем и индуцированных ими сигнальных путей;

определение комплекса взаимодействия сигнальных систем, обеспечивающего поддержание плюрипотентности стволовых клеток, и выявление путей, обуславливающих переход этих клеток в разные типы дифференцировки;

изучение компонентов систем регуляции клеточного цикла;

разработка способов получения линий клеток, не обладающих свойствами трансформированных, не имеющих хромосомных перестроек или дисфункций контрольных точек клеточного цикла;

разработка основ технологий получения генетически модифицированных клеток иммунной системы и стволовых клеток;

создание основ технологий получения хрящевой ткани и сосудов из индуцированных стволовых клеток;

разработка технологии генетической сенсибилизации и перевод на технологическую основу искусственной хромосомы как платформы для генотерапии и обеспечения безопасности тканезаместительной терапии на основе эмбриональных стволовых клеток и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток;

создание линии стромальных клеток, обладающих повышенной способностью к поддержанию кроветворных стволовых и прогениторных клеток человека в культуре, и островков Лангерганса;

разработка клеточных технологий для создания трансплантационного материала на основе трехмерных пористых матриц и с использованием различных типов стволовых, прогениторных и стромальных клеток;

исследование возможностей трансплантологической компенсации различных патологических состояний;

определение молекулярных механизмов кальциевой сигнализации в астроцитах гиппокампуса, выяснение роли молекул внеклеточного матрикса в развитии эпилептиформной активности в нейрональных сетях мозга;

определение молекулярных детерминант, управляющих функционированием депо-управляемых кальциевых каналов, на основе изучения молекулярных механизмов кальциевой сигнализации;

поиск молекулярных механизмов влияния флавоноидов на активность ионных каналов в модельных и клеточных мембранах;

определение роли эндоцитоза в регуляции функционирования рецепторных систем, оценка степени участия сортирующих комплексов и рецепторов во взаимодействии с сигнальными белками;

анализ участия различных сигнальных каскадов в реорганизации цитоскелета;

изучение молекулярных механизмов редокс-регуляции функционирования органелл растительной клетки;

картирование индивидуальности хромосом на основе изучения специфического распределения в геноме тандемных повторов, анализ их транскрипционной активности;

анализ преобразования структурно-функциональной организации хромосом в онтогенезе и клеточном цикле;

определение роли транскрипционных факторов, организации хромосом, интерфазного ядра и цитоплазмы при дифференцировке и перепрограммировании геномов дифференцированных клеток;

выяснение роли белка Daxx в динамике эпигенетического статуса хроматина центромерных и перицентромерных районов;

анализ молекулярно-доменной топографии клеточного ядра и роли экстрахромосомного компартмента нуклеоплазмы в регуляции, сопряжении и координации основных этапов экспрессии генов

61. Биофизика, радиобиология, математические модели в биологии, биоинформатика

изучение механизмов нелинейных явлений в биологических системах различного уровня организации;

создание теоретических основ сетевых динамических взаимодействий молекул, надмолекулярных комплексов (мембран), органелл и структур клеток;

раскрытие механизмов организации круговоротных процессов в замкнутых искусственных экосистемах;

создание компьютерных моделей метаболических превращений и процессов переноса энергии в про- и эукариотических клетках;

разработка новых моделей молекулярно-генетических, биофизических, экосистемных и биосферных процессов;

определение молекулярных и клеточных механизмов формирования и распространения кальциевых волн и их роли в регуляции кооперативного поведения клеточных ансамблей;

разработка новых математических алгоритмов изучения нуклеотидных и аминокислотных последовательностей;

выявление молекулярных механизмов и создание математических моделей функционирования ионных каналов растительных и животных клеток;

теоретические и экспериментальные исследования образования пространственной структуры белков;

разработка новых физических моделей внутримолекулярной подвижности и докинга белков;

раскрытие молекулярных механизмов мышечного сокращения и немышечных форм подвижности;

разработка теоретических алгоритмов расчета термостабильности белков в целях их использования для направленного мутагенеза белков и получения рекомбинантных белков-ферментов с повышенной термоустойчивостью и высокой каталитической активностью;

разработка алгоритмов молекулярного компьютерного моделирования структурно-функциональных свойств биологических соединений, позволяющая проводить направленный отбор лигандов клеточных рецепторов и ферментов;

изучение молекулярно-клеточных механизмов воздействия магнитного поля, в том числе естественного геомагнитного поля, на различные биологические объекты;

определение клеточных мишеней и механизмов, участвующих в генерации ответа клеток на электромагнитные поля и акустические волны, в целях разработки подходов к дистанционному управлению клеточными функциями и лечению клеточных патологий;

разработка методов дозиметрии поглощенной энергии акустических и электромагнитных волн с использованием матричной инфракрасной термографии высокого разрешения;

изучение роли дозированного клеточного стресса под действием различных физических и химических факторов в повышении устойчивости организма человека и животных к действию неблагоприятных условий среды обитания;

изучение влияния сверхвысоких давлений на биологические макромолекулы;

разработка новых оптических методов экспресс-диагностики состояния клетки для использования в биотехнологии и экологическом мониторинге;

расшифровка механизмов внутриклеточной сигнализации в норме и при клеточных патологиях и выявление молекулярных мишеней в системе внутриклеточной сигнализации для фармакологической коррекции функционального состояния клеток;

определение роли рецепторных и каналообразующих белков в сенсорной рецепции;

создание клеточных хемосенсоров для регистрации вкусовых и обонятельных сигналов;

разработка новых биофизических подходов к восстановлению биологического материала растительного и животного происхождения, обнаруженного в условиях вечной мерзлоты;

установление механизмов хронического действия ионизирующей и неионизирующей радиации низкой интенсивности на человека и биоту;

установление механизмов действия на генетический аппарат клеток ионизирующих излучений в низких и высоких дозах;

выявление постгеномных эффектов действия ионизирующей радиации и определение их механизмов;

установление причин индивидуальной радиочувствительности;

разработка математических моделей процессов, инициируемых радиацией в биологических объектах;

выявление биомаркеров оценки лучевых реакций организма, в том числе при облучении опухолей;

создание теоретических основ для выделения групп повышенного радиационного риска среди населения;

установление механизмов реализации эффектов действия малых доз радиации, обнаруженных в эксперименте, на популяционном уровне;

разработка фундаментальных основ создания радиопротекторов нового поколения;

установление механизмов биогенной миграции радионуклидов и закономерностей возникновения отдаленных последствий в популяциях наземных и водных экосистем в условиях хронического радиационного и химического воздействия;

разработка радиоэкологических моделей накопления и миграции радионуклидов;

разработка технологий генетического прогнозирования радиационных рисков авиационных и космических полетов и при работе на атомных предприятиях

62. Биотехнология

развитие высокопроизводительных методов анализа геномов, транскриптомов, протеомов и метаболомов;

разработка биосенсоров и биочиповых технологий для медицинской диагностики, экологического мониторинга и контроля биобезопасности;

создание экспрессных иммунохимических систем детекции биологически активных соединений;

разработка методов анализа техногенных наночастиц для обеспечения биобезопасности населения;

разработка комплексной системы ДНК-идентификации личности;

создание технологической платформы для высокопроизводительного синтеза ДНК;

разработка методов ранней диагностики социально значимых заболеваний на основе генетических и эпигенетических онкомаркеров;

создание биолюминесцентных иммунных и гибридизационных методов и наборов для ранней диагностики социально значимых заболеваний;

разработка инновационных тест-систем для скрининга аутоиммунных больных;

развитие функциональной и сравнительной транскриптомики внутриклеточных бактериальных патогенов;

поиск новых мишеней с использованием геномных и постгеномных платформ для создания новых антибактериальных средств;

создание новых лекарственных и диагностических средств на основе ДНК (РНК) аптамеров;

разработка методов эффективной доставки генно-терапевтических средств в опухоли;

разработка методов специфического уничтожения злокачественных клеток путем воздействия молекулярными конструкциями, включающими регулируемые генные системы и системы с использованием РНК интерференции и родственных механизмов;

конструирование долговременных и адресных лекарственных систем нового поколения в виде микро- и наночастиц, пригодных для различных способов введения;

исследование новых типов многофункциональных золотых и композитных наночастиц для их применения в биологии и медицине, включая тераностику;

получение новых сведений о клеточных и гуморальных механизмах иммунного ответа при использовании наночастиц золота в качестве носителя антигенов и адъюванта;

разработка новых прототипов лекарств, основанных на моноклональных антителах;

получение методом фагового дисплея терапевтических антител человека;

разработка новых типов вакцин и адъювантов на основе технологий биоинженерии;

разработка основ технологии получения противовирусных вакцин путем дезинтеграции вирусной РНК;

разработка основ технологии получения гуманизированных антител против вируса клещевого энцефалита и мини-антител человека против фактора некроза опухолей, интерлейкина 18 и гамма-интерферона;

идентификация бактериофагов, перспективных для создания на их основе средств терапии и медицинских материалов;

разработка новых методов скрининга и оценки эффективности ингибиторов онкологических и инфекционных заболеваний в культурах клеток;

создание систем эффективного культивирования клеток, воздействия на их свойства и направленной дифференцировки для тканевой инженерии и клеточной терапии;

разработка новых подходов для получения in vitro тканей и органов;

разработка клеточных вакцин для терапии онкологических заболеваний;

создание диагностических, вакцинных и иммунокоррегирующих препаратов на основе иммунологически активных белков и биогликанов бактерий и морских гидробионтов;

конструирование продуцентов иммуноактивных белков и репортерных систем;

разработка подходов к созданию в клетках микроорганизмов биосинтетических путей, не встречающихся в природе;

осуществление биотехнологических процессов получения биологически активных соединений, биоматериалов и продуктов органического синтеза из возобновляемого сырья, предназначенных для замещения традиционных химических производств и создания новых продуктов и материалов с уникальными свойствами;

развитие фундаментальных принципов и прикладных применений метода наноколоний клеток, ДНК и РНК;

развитие технологии высокопроизводительного бесклеточного синтеза белков;

разработка биотехнологий получения и модификации хитина и хитозана в целях создания нового поколения биологически активных веществ;

разработка новых биотехнологических методов получения стероидных лекарственных препаратов с использованием в процессе биотрансформации вновь созданных иммобилизованных биокатализаторов;

разработка ресурсосберегающих экологических технологий производства целлюлозы из различных источников сырья;

создание научных основ производств биопластиков и композиционных материалов на их основе для медицинских целей;

разработка технологии безотходной переработки бытовых, сельскохозяйственных и промышленных отходов с получением полезных продуктов;

разработка технологии рекультивации свалок и полигонов твердых бытовых отходов;

разработка технологии очистки окружающей среды от токсичных и устойчивых загрязнителей;

разработка эффективных энергосберегающих технологий очистки сточных вод;

разработка фундаментальных основ создания новых сортов и линий основных сельскохозяйственных культур с улучшенными хозяйственно-ценными признаками, в том числе устойчивых к абиотическим и биотическим стрессам, с использованием постгеномных биотехнологий;

развитие систем молекулярной диагностики фитопатогенов;

разработка фундаментальных основ получения биотехнологических форм древесных растений с улучшенными характеристиками