5.2. Генетический мониторинг циркуляции вирусов кори, краснухи и эпидемического паротита

5.2.1. Генетический мониторинг циркуляции возбудителей кори, краснухи и эпидемического паротита проводится в ННМЦ.

Генетическая характеристика возбудителей применяется для оценки статуса передачи вирусов кори и краснухи - эндемичная или неэндемичная, что является одним из ключевых аспектов верификации элиминации этих инфекций. Определение генетической принадлежности вируса эпидемического паротита позволяет охарактеризовать генетический пейзаж вируса в стране.

Генотипирование вирусов кори, краснухи и эпидемического паротита заключается в определении генотипа; для вируса кори дополнительно определяют генетическую линию и (или) генетический вариант.

Выборка образцов от больных корью и краснухой, подлежащих отправке в ННМЦ для последующей генетической характеристики, осуществляется в соответствии с методическими документами <30>.

--------------------------------

<30> МР 3.1.2.0135-18 "Генетический мониторинг циркуляции вирусов кори и краснухи", утвержденные руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителя и благополучия человека, Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 08.11.2018 (далее - МР 3.1.2.0135-18).

Проводить отбор клинических образцов (образцы мочи и назофарингеальные соскобы) для генотипирования от всех случаев кори или с подозрением на корь.

Направлять в обязательном порядке на генотипирование образцы от:

- первых 5 - 10 случаев в каждой вспышке; если она длится более 1 месяца, то в дальнейшем рекомендуется собирать образцы от последних 2 - 3 случаев в месяц;

- импортированных или завозных случаев кори из других субъектов Российской Федерации; если отбор материала от импортированного/завозного случая невозможен, то генотипированию подлежат образцы от нескольких связанных случаев (при их наличии);

- спорадических случаев заболевания;

- больных корью с тяжелой формой течения и летальных исходов.

В других случаях - по согласованию с ННМЦ.

Для генетической характеристики вируса эпидемического паротита в ННМЦ направляются образцы от максимально возможного количества больных. Сбор, хранение и транспортировка образцов для генотипирования осуществляется ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии" в субъектах Российской Федерации или медицинской организацией, выявившей случай заболевания, в соответствии с санитарно-эпидемиологическими требованиями <31>.

--------------------------------

<31> Глава IV СанПиН 3.3686-21.

5.2.2. Для генетической характеристики возбудителей целесообразно организовать сбор и транспортировку в ННМЦ следующих клинических образцов:

- назофарингеальный соскоб и моча от больных корью и краснухой, собранные не позднее 7 дня со дня появления сыпи;

- мазки со слизистой с внутренней стороны щеки с пораженной стороны от больных эпидемическим паротитом, взятые не позднее 5 дня со дня появления клинических симптомов.

Мочу необходимо собирать в стерильный пластиковый контейнер. Соскоб необходимо брать стерильным одноразовым тампоном, который после сбора помещается в пробирку 1,5 - 2,0 мл, содержащую 1 мл физиологического раствора или вирусологической транспортной среды (например, среда Игла, модифицированная Дульбекко (англ. Dulbecco's Modified Eagle Medium, DMEM). Тампон следует отжать о стенки пробирки, после чего удалить из пробирки.

Образцы биологического материала для генотипирования доставляются в ННМЦ в течение 48 часов с момента сбора с соблюдением "холодовой цепи"; хранение образцов до доставки в лабораторию осуществляется при температуре плюс 2 - 4 °C <32>.

--------------------------------

<32> МР 3.1.2.0135-18.

5.2.3. В случае отсутствия возможности доставки образцов в течение 48 ч образцы целесообразно подготовить следующим образом:

- центрифугировать образец при 3000 об/мин в течение 10 мин;

- перенести осадок в пробирку 1,5 - 2,0 мл с транспортной средой в соотношении 1:1;

- пробирки промаркировать, заморозить при температуре минус 20 - 70 °C для дальнейшего хранения; отправить подготовленные образцы в ННМЦ в контейнере с соблюдением "холодовой цепи". Поскольку генетическая принадлежность вирусов кори, краснухи и эпидемического паротита не имеет значения с точки зрения диагностики заболеваний и лечения больных, не требует изменения тактики санитарно-противоэпидемических (профилактических) мероприятий и мероприятий в очагах, генотипирование может быть проведено ретроспективно после накопления образцов.

Результаты генотипирования по его завершении направляются в учреждения, отправлявшие материал, не позднее 5 календарных дней с момента завершения исследований, окончательных результатов, в том числе секвенирования - не позднее 7 календарных дней с момента их завершения.

Результаты генотипирования вирусов кори, краснухи и эпидемического паротита должны быть получены и внесены в ЦИСИЗ не позднее 2 месяцев со дня доставки образцов в ННМЦ.