Молекулярно-генетическое исследование

- Пациентам с выявленной СМТ, подозрительные на отдельные варианты СМТ, рекомендуется выполнение молекулярно-генетических исследований в зависимости от подозреваемого типа опухоли (таблица 7) с целью молекулярно-генетической верификации опухоли [17, 18, 45 - 49].

Уровень убедительности рекомендаций C (уровень достоверности доказательств 4)

Таблица 7. Специфические транслокации при СМТ

Комментарий: молекулярно-генетические маркеры являются высокоспецифичными (патогномоничными) критериями отдельных типов сарком мягких тканей. Целесообразность их выявления и необходимый перечень определяются гистологическим типом опухоли и диагностической задачей, стоящей перед патологом. Материалом для проведения исследования является ткань опухоли, фиксированная в формалине и залитая в парафиновый блок. Назначение молекулярно-генетических диагностических методик осуществляется врачом-патологоанатомом, который готовит материал для соответствующего исследования. Проведение данных диагностических методик возможно только в условиях референс-лаборатории.

Правильный гистологический диагноз СМТ основывается на морфологической характеристике и целом ряде иммуногистохимических маркеров (напр., миогенин, MyoD1, десмин, виментин, миоглобин, актин, нейронспецифическая энолаза, S-100, MIC2), которые должны определяться в обязательном порядке.

Для диагностики NTRK транслокаций пациентам с подозрением на инфантильную фибросаркому, пациентам с сочетанием экспрессии CD34 и S100 в опухоли и пациентам с неверифицированными саркомами, что особенно актуально для детей первого года жизни, предпочтительно выполнение pan-TRK ИГХ скрининга, верификация доступным молекулярно-генетическим методом (FISH, ПЦР, NGS). Учитывая большое количество генов-партнеров, вариантов перестроек генов NTRK и ограничения методов FISH и ПЦР, предпочтительно направление в референсную лабораторию для выполнения NGS исследования [19].

Молекулярно-генетическое исследования с целью уточнения диагноза предпочтительно при веретеноклеточной/склерозирующей (ВС) РМС (определение миссенс-мутации MYOD1 p.L122R), эмбриональной РМС (для дифференциальной диагностики с ВС РМС), альвеолярной РМС (определение перестроек гена FOXO1 и/или экспрессии химерных генов PAX3::FOXO1 и PAX7::FOXO1). В случае недифференцированных сарком предпочтительно исследование аберраций и/или экспрессии химерных генов с участием EWSR1, CIC, BCOR для дифференциальной диагностики опухолей группы недифференцированных сарком костей и мягких тканей (саркома Юинга, саркомы с 28 перестройками гена EWSR1 с генами, не принадлежащими к семейству ETS (EWSR1 - non-ETS), саркома с перестройками гена CIC, саркома с аберрациями гена BCOR), а также генов протеинкиназ (семейства NTRK, ALK, ROS1, RET, BRAF) для диагностики новообразований группы веретеновидноклеточных опухолей с перестройками генов TRK и определении показаний для молекулярно-направленной терапии [17, 18].

Молекулярно-генетическое исследование может быть полезно для верификации синовиальной саркомы, десмопластической мелкокруглоклеточной опухоли, фибромиксоидной саркомы низкой степени злокачественности, светлоклеточной саркомы мягких тканей и других опухолей с наличием рекуррентного молекулярного маркера. Исследование химерных генов предпочтительно проводить с использованием РНК в качестве аналита. При низкой вариабельности химерного гена (PAX3::FOXO1, PAX7::FOXO1, ETV6::NTRK3, EWSR1::FLI1) возможно использование метода ПЦР с обратной транскрипцией, в случае высокой вариабельности точки разрыва и/или гена-партнера рекомендуется применение метода высокопроизводительного секвенирования РНК [17, 18].