Организация лабораторных исследований при ВП

4.2. Лабораторные исследования по этиологической расшифровке спорадической заболеваемости ВП проводятся в лабораториях МО в соответствии с действующими нормативными и методическими документами <10>.

--------------------------------

<10> Приказ Минздрава России от 20.12.2012 N 1213н "Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при пневмонии"; глава XL СанПиН 3.3686-21.

При проведении эпидемиологического расследования эпидемического очага ВП исследования материала от больных могут проводиться в лаборатории как МО, так и в организации, обеспечивающей проведение государственного санитарно-эпидемиологического надзора.

При летальных исходах исследования материалов, полученных при патологоанатомическом исследовании, могут проводиться как в МО, так и в организациях, обеспечивающих федеральный государственный санитарно-эпидемиологический надзор.

Материал от лиц, подвергшихся риску заражения, или лиц, подозреваемых в качестве источников инфекции в эпидемическом очаге, проб окружающей среды отбирается и исследуется в организации, обеспечивающей проведение государственного санитарно-эпидемиологического надзора.

4.2.1. Спектр биологического материала, используемого для этиологической диагностики ВП, правила его получения, условия хранения и транспортирования могут отличаться в зависимости от микроорганизма и применяемых методов диагностических исследований. При проведении сбора биоматериала, его хранения и транспортирования следует руководствоваться приложением 2 к настоящим МУ.

4.2.2. Биологический материал у пациента берут до назначения антибактериальной терапии, в случае госпитализации - в первые сутки, при амбулаторном ведении больного - как можно раньше от момента появления симптомов острой респираторной инфекции.

4.2.3. В случае летального исхода для определения этиологии ВП исследуется посмертный (аутопсийный) материал пораженной ткани легких, бронхов, селезенка и другие пораженные органы.

4.2.4. При обследовании контактных лиц (практически здоровых, больных с хронической патологией дыхательной системы) с целью выявления стертых форм и источников возбудителя инфекции рекомендуется брать мазки со слизистой оболочки носоглотки и слизистой оболочки задней стенки ротоглотки.

4.2.5. Используемые при диагностическом исследовании тест-системы, наборы реагентов, препараты, микробиологические среды должны быть зарегистрированы на территории Российской Федерации в установленном порядке <11>.

--------------------------------

<11> Статья 38 Федерального закона от 21.11.2011 N 323-ФЗ "Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации" (далее - Федеральный закон от 21.11.2011 N 323-ФЗ).

4.2.6. Для проведения углубленных исследований молекулярно-биологическими (секвенирование нуклеиновых кислот) и другими методами положительные пробы биологического материала и выделенные культуры микроорганизмов из очагов групповой заболеваемости ВП направляются в региональный научно-методический центр по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней или в референс-центр Роспотребнадзора по мониторингу за инфекциями в соответствии с законодательством Российской Федерации <12> по предварительному согласованию с сотрудниками центра.

--------------------------------

<12> Приказ Роспотребнадзора от 01.12.2017 N 1116 "О совершенствовании системы мониторинга, лабораторной диагностики инфекционных и паразитарных болезней и индикации ПБА в Российской Федерации" (далее - Приказ Роспотребнадзора от 01.12.2017 N 1116).

4.2.7. В случае инфекции, вызванной Mycoplasma pneumoniae или Mycoplasma pneumoniae в ассоциации с другими возбудителями, биологический материал направляется в ФБУН "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Роспотребнадзора, ФБУН "Научно-исследовательский институт системной биологии и медицины".

В случае коронавирусной инфекции или высокопатогенного гриппа птиц образцы направляются в ФБУН "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Роспотребнадзора, при других этиологических агентах вирусной природы - в ФБУН "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Роспотребнадзора.

Перечень организаций Роспотребнадзора, выполняющих углубленные исследования возбудителей ВП, может быть расширен в случае принятия руководством Роспотребнадзора соответствующих решений.

При проведении лабораторного обследования лиц из групповых очагов ВП на базе МО, пробы биологического материала, в которых обнаружены возбудители ВП, передают в ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии" Роспотребнадзора в субъекте для последующего направления в референс-центры.

4.2.8. Для проведения углубленных исследований культивируемых бактериальных возбудителей ВП в научно-методические и референс-центры в установленном порядке <13> направляют выделенные культуры микроорганизмов, дополнительно (по согласованию с референс-центром) может быть отправлен биологический материал или дезоксирибонуклеиновая кислота (далее - ДНК)/комплементарная ДНК (далее - кДНК) возбудителей.

--------------------------------

<13> Приказ Роспотребнадзора от 01.12.2017 N 1116.

Для проведения углубленных исследований вирусных возбудителей ВП в референс-центры следует высылать биологический материал с достаточным содержанием нуклеиновых кислот вирусов, ориентируясь на результат полимеразной цепной реакции с детекцией в реальном времени (далее - ПЦР-РВ) (значение порогового цикла (Ct) в образце должно быть не более значения Ct положительного контрольного образца, к которому прибавлено число 3) дополнительно (по согласованию с референс-центром) могут быть отправлены образцы ДНК/кДНК.

Направляемые образцы следует сопровождать клинико-эпидемиологическими данными о пациенте и информацией об образцах согласно перечню (приложение 3 к настоящим МУ).

4.2.9. При проведении углубленных исследований возбудителей ВП (типирование, идентификация факторов патогенности и резистентности к антимикробным препаратам и дезинфектантам) могут применяться лабораторные методики, разработанные научно-методическими и референс-центрами.