Дифференциальная диагностика боковых и срединных кист проводится

- с хроническими специфическими и неспецифическими лимфаденитами шеи. Уточнению диагноза поможет проведение объективного исследования, КТ, МРТ, проведение цитологического исследования микропрепарата тонкоигольной аспирационной биопсии.

- дермоидными кистами челюстно-лицевой области;

- опухолями слюнных желез. Важными диагностическими моментами являются показатели контрастной сиалографии, МРТ и КТ;

- каротидной хемодектомой. Уточнению диагноза поможет проведение КТ-ангиографии, МРТ, ангиографии.

- метастатическими опухолями шеи, бранхиогенным раком, лимфо- и ретикулосаркомами, гемангиомами и лимфангиомами.

- боковые свищи шеи также дифференцируют от свищей, возникших в результате нагноения лимфатических узлов шеи.

Магнитно-резонансная томография, цисто-, фистулография, цитологическое исследование микропрепарата тонкоигольной аспирационной биопсией, трепанбиопсия опухолей наружных локализаций, лимфатических узлов под визуальным контролем с последующим патолого-анатомическим исследованием биопсийного (операционного) материала, инцизионная биопсия с последующим патолого-анатомическим исследованием биопсийного (операционного) материала позволяют уточнить диагноз.